Esta colecção surge de forma destacada no seio do espólio do MSML, não só pela dimensão, como também pela qualidade das peças que a incorporam e pela variedade tipológica das mesmas, podendo estas serem organizadas em diversas sub-colecções. A Imaginária, precioso legado de múltiplas épocas e estilos, reúne em simultâneo a produção proveniente das oficinas de santeiros e a produção de carácter erudito. Estas encontram-se essencialmente expostas no piso superior do Museu. A Talha Dourada, nas suas mais diversas manifestações: retábulos, nichos, sanefas, plintos…exemplares através dos quais podemos contactar com os vários estilos de talha portuguesa, sendo de evidenciar a particularidade de se assumir enquanto suporte expositivo da Imaginária e Pintura, sendo esta uma outra sub-colecção, predominante ao nível dos tectos e predelas de alguns retábulos espalhados pelas diversas salas que constituem o Museu. Ainda as vestes e o Mobiliário Litúrgico, composto este por um excepcional número de oratórios das mais distintas naturezas.